Магистърската програмата е с продължителност 4 семестъра и се провежда в задочна форма на обучение. Тя е специално разработена за кандидати, които вече притежават образователно-квалификационна степен „бакалавър“ или „магистър“ в други области на висшето образование или други професионални направления. Завършилите придобиват професионална квалификация „Учител по физическо възпитание“. Основната цел на магистърската програма е изграждането и задълбочаването на общата педагого-психологическа и тясно специализираната методическа подготовка. Студентите придобиват знания и умения в следните направления: Педагогически, психологически и медико-биологични основи на физическото възпитание и спорта. Подробно изучаване на методиката на обучение по футбол, лека атлетика, хандбал, волейбол, баскетбол, гимнастика, туризъм и ориентиране. Работа в дигитална среда, прилагане на ИКТ в обучението и използване на съвременни образователни технологии. Адаптирано физическо възпитание, кинезитерапия и теория на спортната тренировка. Магистрите формират ключови компетентности свързани с: планиране, провеждане, ръководство, оценяване и контрол на: образователната дейност по физическо възпитание и спорт, спортно-състезателната и тренировъчна работа по вид спорт в образователната среда, рекреационни занимания със спортна насоченост; оптимално реализиране на педагогически взаимодействия чрез индивидуална и екипна работа в условията на спортнодвигателната дейност; проектна и прогностична дейност в сферата на училищното физическо възпитание.