1. Насоченост, образователни и научни цели

Докторската програма по научна специалност „Биохимия“ от ПН „Биологически науки“ в Аграрния факултет на Тракийски университет е с продължителност 3 години за редовно обучение, 4 години за задочно обучение и 5 години за докторанти в самостоятелна форма на обучение, и цели за изгради висококвалифицирани специалисти в областта на Биохимията. Главната цел на докторската програма е да даде на докторантите задълбочена теоретична подготовка по фундаментални за спецификата на съответната докторантура области на познанието и практически умения. Учебното съдържание на докторската програма акцентира върху предоставяне на базови знания по конкретната тема на съответната докторантура. Крайната цел от обучението по докторантурата е придобиване на ОНС „Доктор“ по Екология и опазване на екосистемите. Биохимията е наука разглеждаща строежа, структурата и преобразуването на химичните вещества в живия организъм. Фундаменталното ѝ значение се открои през последните десетилетия, след като на базата на нейните постижения се развиха бурно цял спектър от биологични науки включително и такива като Екологията, Биотехнологиите и др

2. Обучение и научна подготовка (знания и умения, необходими за успешна професионална реализация)

Основната концепция, върху която е изградено обучението по докторската програма е, че придобиването на висока квалификация и практически учения, необходими за успешна професионална реализация, е възможно на базата на задълбочени знания за процесите и явленията. Ето защо докторантите обучавани по програмата “Биохимия” придобиват солидни знания относно следните аспекти:

А) Състав и свойства на живия организъм. В тази част се изучават основните групи органични вещества – въглехидрати, липиди, белтъци и нуклеинови киселини, както и ензимите /като биологични катализатори/ отговорни за обмяната на веществата и енергията.

Б) Обмяна на веществата и енергията. В тази част докторантите придобиват знания и умения относно общите принципи на метаболизма; биохимична енергетика; обмяна на въглехидрати, липиди, белтъци и аминокиселини; пуринови и пиримидинови бази; биосинтеза на нуклеинови киселини и предаване на генетичната информация; антиоксидантна защита и детоксикационни процеси.

В) Специални аспекти на биохимията. Това е частта даваща на докторантите широк спектър от знания относно: състав и свойства на витамините и витаминоподобните вещества; биохимия на храносмилането и процесите на транспорт на хранителните вещества; биохимия на кръвта; биохимия на бъбреците и урината; биохимия на нервната проводимост и мускулното съкращение; биохимия на хормоните; биохимия на черния дроб и детоксикационните процеси протичащи в него; биохимия на хидроекосистемите;  и пр. Освен това се дават и основни познания относно  биотехниката на размножаването на хидробионтите, биохимичните механизми на оплождането на хайвера и ембрионалната развитие на стопански значими риби. Изучават се и специфични аспекти относно полиплоидизацията, хибридизацията и др. биотехнологични прийоми за повишаване продуктивността на аквабионтите, обект на култивиране у нас и в чужбина. Докторантите получават специални умения и познания за професионална намеса в производствените процеси в аквапониката и оранжерийното производство и успешното им прилагане при денитрификация, карбонизация и други екологосъобразни прийоми за получаване на повече и по-екологична продукция от растения и животни. С отличните си познания по биохимия на растенията, те ще умеят да повлияват такива важни процеси като фотосинтезата, гликогенезата, гликонеогенезата и др. Тези познания ще се използват при карбонизиране на атмосферата в оранжериите, оптимизиране на биотехнологичните параметри при съхраняване на плодове и зеленчуци в плодохранилищата и др. Освен това специалистите с ОНС „Доктор“ по биохимия ще могат да консултират агрономи, зооинженери, ветеринарни и хуманни лекари относно фармакокинетиката на биологичноактивни вещества, лекарства, ксенобиотици, препарати за растителна защита и др. Превенцията и борбата със стопански значими метаболитни разстройства и заболявания, като кетоацидозата по високопродуктивните лактиращи животни, диабета и пр. би могла да се води по-ефективно с помощта на докторите по биохимия които са обучавани в АФ на ТрУ.

Г). Биотехнологии. В тази част докторантите придобиват знания и умения относно редица биотехнологични методи, включително и биокатализата, използвани от съвременната наука и практика. Изучават се съвременни екологосъобразни технологични процеси  и биотехнологии за преработка на суровини и материали за производство на биопродукти включително и на биогорива. Изучават се взаимовръзките между биотехнологиите и: биоенергетиката,  микробиологията, генетиката, медицината, селското стопанство, лесовъдството, хранително-вкусовата и химическата промишленост, опазването на околната среда и пр. В този аспект специалистите с ОНС „Доктор“ по биохимия ще могат да консултират заинтересованите професионалисти в биотехнологични предприятия за преработка на селскостопанска продукция и производство на храни, напитки и биогорива. Специалистите завършили докторантура по биохимия в АФ при ТрУ имат знанията и уменията да управляват и ръководят биотехнологични процеси свързани с млечнокиселата, оцетнокиселата и алкохолната ферментации и производството на млечнокисели продукти, консервирани храни и фуражи, както и биогорива, случващи се в компонентите на околната среда и в екосистемите, както и при овладяването на съвременни методи и изследователски практики в избраното научно поприще. Докторската програма по Екология и опазване на екосистемите осигурява фундаментални знания по екология и опазване на околната среда, замърсяване и опазване на въздуха, водите и почвите, въздействие на замърсителите върху екосистемите и биологичното разнообразие, мониторинг и оценка на състоянието на компонентите на околната среда и управление на отпадъците. Базови знания докторантите придобиват по методология и методика на научните изследвания и по основни методи за използване на статистически софтуер за обработка на данни от проведената експериментална работа.

3. Професионални компетенции

Докторантите, придобили ОНС „Доктор“ по докторската програма „Биохимия“ притежават задълбочени теоретична подготовка, адекватна за детерминиране на актуални практически умения и знания. Съвременния специалист е наложително да познава основните взаимодействия на биомолекулите, както в живата клетка, така и в интактните ферментатори използващи в биотехнологията си имобилизирани ензими. В този аспект бурното развитие на една интердисциплинарна наука каквато е например Биотехнологията ще има нужда от добре подготвени кадри с широк спектър от познания, даващи възможност за незабавно интегриране в съвременното екологосъобразно производство. От тук проличава изключителната практическа насоченост на тази наука позиционирана между строго фундаменталната Биохимия и съвременните научно-приложни биологични дисциплини обслужващи редица сфери в селското стопанство, хранително-вкусовата и химическата промишленост, ветеринарната и хуманната медицина и пр.. Те трябва да владеят поне един чужд език, до степен да ползват специализираните литературни източници, да имат висока езикова култура, да могат самостоятелно да надграждат знанията и уменията си и да се стремят постоянно да повишават своята квалификация.